Режим Баас провел военную операцию «Анфаль», осуществив целую серию нападений на курдское население и другие меньшинства, включая ассирийских христиан и халдеев, в сельских районах северного Ирака в период между 1986 и 1989 годами. Слово «анфаль» означает «военные трофеи», «добычу», представляя собой отсылку к восьмой суре Корана, в которой описывается акт войны против неверных. В 1988 году операция вышла на пик. Систематическое истребление курдов продолжалось с 23 февраля по 6 сентября 1988 года.

Курдское население, терпевшее угнетение со стороны режима, выступало на стороне Тегерана в ирано-иракской войне с 1986 года. Перед началом резни часть территорий в курдских районах объявили «зонами безопасности», насильственно выселяя местное население. Людей обвиняли в том, что они являются иранскими агентами, невзирая на возраст и пол, вынуждая их бежать. Оставшиеся были подвергнуты экспатриации. В ходе этого геноцида были убиты до 182 000 курдов; ещё миллионы были ранены, оставили свои дома или попали в концентрационные лагеря, обреченные на мучительную смерть от голода. С лица земли были стерты более 4 000 деревень, 1 800 школ, 300 больниц, 3 000 мечетей и 27 церквей. Самой известной атакой за месяцы и годы этой кампании стало использование химического оружия в Халабдже 16 марта 1988 года.

Операция «Анфаль» проводилась по приказу Али Хасана аль-Маджида, двоюродного брата Саддама Хусейна, которого прозвали «Химический Али». Кампания состояла из восьми этапов. В 2006 году Специальный трибунал Ирака (Высший уголовный трибунал) квалифицировал преступления режима Баас против курдов, как акт геноцида. В ходе процесса по этому делу аль-Маджид и другие иракские чиновники были осуждены в июне 2007 года за преступления против человечности, военные преступления и геноцид.